La Iniciativa Científica Milenio es un programa de la Agencia Nacional de Investigación y Desarrollo (ANID), perteneciente del Ministerio de Ciencia, Tecnología, Conocimiento e Innovación de Chile

En el largo plazo, el objetivo del programa es mejorar la calidad e impacto de la investigación chilena. Para cumplir esta misión Milenio se sustenta en cuatro pilares: investigación competitiva a nivel internacional, formación de nuevos científicos, formación y mantención de redes internacionales de colaboración y promoción del conocimiento hacia la sociedad.

Los Centros Milenio se diferencian, principalmente, en el período de financiamiento y cantidad de investigadores. Los Núcleos Milenio son financiados por tres años con la posibilidad de renovar por la misma cantidad de tiempo y los Institutos Milenio reciben financiamiento por diez años, con una evaluación en la mitad de este periodo.

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