Secretaría Ejecutiva
La Secretaría Ejecutiva de Milenio es la encargada de la gerencia del programa. Gestiona concursos regulares desde 1999, sin interrupción, articula a los Centros Milenio con el sector público, educacional, regional y privado; apoya las comunicaciones; conecta centros entre sí y facilita la gestión general de los Núcleos e Institutos Milenio.